肠溃疡可以使用黄连素、柳氮磺胺吡啶、补脾益肠丸等药物治疗，黄连素是一种比较常见的中药，这种药物含有盐酸小檗碱，具有清热燥湿、止泻的效果，主要用于治疗肠道感染，不仅能够帮助改善肠溃疡症状，并且对于痢疾感染也具有治疗作用。柳氮磺胺吡啶在溃疡性肠炎的治疗上比较常见，不仅能够针对轻度和中度溃疡性结肠炎具有治疗的作用，还可以辅助重度溃疡性结肠炎的治疗。柳氮磺胺吡主要在肠道中分解，可以达到抗炎、抗菌的双重作用，并且药效持续时间比较长、副作用相对比较少。部分人出现肠溃疡是由于肠胃功能虚弱导致的，可以适当补充补脾益肠丸，这种药物不仅可以提高脾胃功能，同时还可以促进肠道免疫力的提高，因此有助于改善肠溃疡病情。部分人出现肠溃疡是由于免疫失调导致的，这些人在使用药物时也可以适当结合免疫调节剂。